Logiciel Facturation Certifié

Sélection d’outils de facturation certifiés conformes à la réglementation française. Évaluations approfondies des fonctionnalités, grilles tarifaires et niveaux de certification pour retenir la solution adaptée à votre structure. Rationalisez votre gestion comptable tout en respectant vos obligations légales.

Logiciel Facturation Certifié

Facturation certifiée : conformité et bonnes pratiques

Un logiciel de facturation certifié garantit l'inaltérabilité et la conformité de vos factures à la réglementation. Côté achats, maîtriser le traitement des factures fournisseurs complète la démarche pour une comptabilité sans faille. Le classement ci-dessous compare les solutions certifiées.

Ilan Lemos
Ilan Lemos·Expert Logiciel de Gestion
15 janvier 2026
30 janvier 2026
6 min
Méthodologie

Notre verdict en 30 secondes

Notre évaluation de 10 outils de facturation certifiés révèle des arbitrages décisifs entre conformité (piste d’audit, inaltérabilité), richesse fonctionnelle et rapport valeur/prix. Pennylane s’affirme en tête pour sa conformité moderne et son intégration bancaire native, Sellsy se démarque par son approche commerciale intégrée, tandis qu’Axonaut complète le trio avec sa couverture tout-en-un adaptée aux TPE/PME.

💎 Pennylane : Conformité moderne et comptabilité intégrée
🚀 Sellsy : Facturation certifiée + CRM commercial
🇫🇷 Axonaut : Solution tout-en-un certifiée pour TPE/PME

Logiciel Facturation Certifié

Top 01
Pennylane

Pennylane

4.6/5

Pennylane est le logiciel de comptabilité français tout-en-un: facturation électronique, synchronisations bancaires, compte pro et cartes, pilotage de trésorerie en temps réel, collaboration native avec votre expert-comptable.

Points forts

  • Pilotage de trésorerie en temps réel

  • Synchronisations bancaires et paiements intégrés

  • Compte pro et cartes inclus pour centraliser les dépenses

Inconvénients

  • Automatisations avancées limitées sur le plan Basique

  • Tarifs qui montent avec la taille de l'entreprise et le nombre de salariés

Prix

14€ - 79€/mois HT

Utilisateurs

Par entreprise

Essai gratuit

14 jours

Support

Chat & Email

Top 02
Sellsy

Sellsy

3.8/5

Sellsy est une suite française CRM et facturation regroupant gestion des ventes, devis, factures et trésorerie. Utilisée par 23 000+ entreprises, elle offre une API REST v2 et des applications mobiles pour centraliser la croissance des PME.

Points forts

  • Suite CRM + facturation native, conforme RGPD et hébergée en France

  • API REST v2 et intégrations, modules complémentaires (trésorerie)

  • Applications mobiles iOS et Android pour les équipes terrain

Inconvénients

  • Tarifs qui augmentent selon les modules et le nombre d'utilisateurs

  • Interface dense avec une courbe d'apprentissage pour les nouveaux utilisateurs

  • Offres et options multiples pouvant complexifier le choix

Prix

De 35 à 79 € HT/utilisateur/mois, engagement 12 mois

Utilisateurs

2 utilisateurs minimum

Essai gratuit

14 jours

Support

Chat & Email

Top 03
Axonaut

Axonaut

4.6/5

Axonaut est une plateforme de gestion tout-en-un française pour TPE et PME qui regroupe CRM, facturation, trésorerie, stock, comptabilité, compte pro et davantage dans une interface claire et abordable.

Points forts

  • Plateforme 100% française tout-en-un : CRM, facturation, trésorerie, stock, comptabilité, compte pro et bien plus dans une interface claire et abordable

  • 320 000 utilisateurs et adoption continue : déployée par plus de 12 000 structures françaises

  • Application mobile complète (iOS et Android) avec API pour intégrations avancées + MCP pour la connexion avec les LLMs

Inconvénients

  • Périmètre étendu pouvant sembler surdimensionné pour les micro-entreprises qui n'ont besoin que d'un seul module

  • Fonctionnalités insuffisantes pour les ETI et grands comptes nécessitant un ERP avancé

  • Catalogue d'intégrations tierces plus réduit que celui des acteurs internationaux comme Salesforce ou HubSpot

  • Prise en main de l'ensemble des modules demande un temps d'adaptation, notamment pour les utilisateurs non-techniques

  • Module comptable adapté aux usages courants mais limité pour des besoins de comptabilité analytique poussée

Prix

À partir de 38 € HT/mois selon la durée

Utilisateurs

1 inclus (+29,99 €/user)

Essai gratuit

14 jours

Support

Chat & Email

Autres alternatives à considérer

Alternative
JLogiciels

JLogiciels

JLogiciels est un éditeur français (depuis 2005) de solutions de gestion modulaires en SaaS : facturation, devis, caisse, stock et CRM, conçu pour les TPE, PME et artisans.

Prix:

Dès 29€/mois

Modules sectoriels pensés pour le BTP, le commerce et la distribution

Plus de 20 ans d'expérience sur le marché de la gestion pour TPE et artisans

Alternative
Facture.net

Facture.net

Facture.net : outil de facturation sans frais à vie avec devis et gestion clients illimités, et CRM intégré.

Prix:

Hébergé: 0€/mois

Accès sans frais et sans limite de durée, devis et factures en quantité illimitée

CRM embarqué pour gérer contacts et opportunités commerciales

Alternative
Qonto

Qonto

Qonto est la solution française de gestion financière pour indépendants et PME : compte pro, cartes, facturation et pilotage des dépenses, intégrations comptables (Sage, Cegid, Pennylane) et API. Essai gratuit 30 jours.

Prix:

À partir de 9€/mois (HT)

Interface et support en français : Conçu pour le marché français, conformité locale

Facturation et comptabilité intégrées : Devis/factures, rapprochement automatique, export vers Sage, Cegid, Pennylane

Alternative
MY.Facturation

MY.Facturation

MY.Facturation facilite la gestion de la facturation en ligne : devis, factures et fiches clients en quelques actions, avec une formule gratuite et plusieurs utilisateurs sans coût supplémentaire.

Prix:

Gratuit à 50.00€ HT/mois

Interface épurée et facile à prendre en main

Tarification accessible pour les TPE et indépendants

Alternative
Indy

Indy

Indy est un logiciel français de comptabilité et de facturation pour indépendants. Son plan gratuit comprend la synchronisation bancaire, les devis, les factures et un compte pro optionnel.

Prix:

0 € ; Plus dès 9 € HT/mois en annuel

Plan gratuit permanent avec facturation et comptabilité automatisée

Synchronisation bancaire et catégorisation automatique des transactions

Alternative
Henrri

Henrri

Henrri est le logiciel de facturation gratuite du groupe Rivalis. Son offre Pro inclut les devis, factures, avoirs, utilisateurs et échanges de factures électroniques sans plafond.

Prix:

0 € ; Expert dès 12 € HT/mois en annuel

Factures, devis, avoirs et utilisateurs illimités dans l'offre gratuite

Émission et réception de factures électroniques incluses via la PA Pennylane

Alternative
Zervant

Zervant

Zervant est un outil de facturation pour freelances et petites structures, avec un plan gratuit limité à 5 clients et 5 factures par mois, e-facturation, envoi postal selon quotas, et applications mobiles iOS/Android.

Prix:

0 € ; formules payantes selon l'offre

Plan gratuit: 5 clients et 5 factures/mois

Applications mobiles iOS et Android

Alternative
Evoliz

Evoliz

Evoliz est un outil de facturation français tout-en-un pour PME, avec CRM, stocks et comptabilité embarqués. Certifié NF 203 et NF 525 pour la conformité fiscale, il permet de piloter l'ensemble de vos flux commerciaux depuis une plateforme unique.

Prix:

À partir de 16€/mois HT (annuel)

Double certification NF 203 et NF 525 garantissant la conformité fiscale française

Facturation, synchronisation bancaire, stocks et CRM réunis dans un seul outil

Alternative
EBP Compta

EBP Compta

EBP Compta regroupe les solutions comptables de l'éditeur français EBP pour les TPE et PME. EBP Comptabilité Hubbix fonctionne en ligne. Il automatise une partie de la saisie, synchronise la banque, facilite la TVA et ouvre un accès à l'expert-comptable. La facturation repose sur un logiciel EBP associé.

Prix:

Dès 31,50 € HT/mois avec engagement

Synchronisation bancaire et rapprochement intégrés, face à une approche plus globale chez Pennylane

Accès expert-comptable inclus pour travailler dans le même dossier

Alternative
Xero

Xero

Xero est un logiciel de comptabilité cloud pour PME avec facturation, connexion bancaire, rapprochement et plus de 1 000 intégrations. L'éditeur revendique plus de 4,9 millions de clients. Il ne documente toutefois aucune édition fiscale française et n'est pas une plateforme agréée en France.

Prix:

De 29 à 75 $US/mois sur l'offre globale

Rapprochement bancaire automatisé

Écosystème de 1 000+ intégrations

Alternative
Sage Business Cloud Compta & Facturation

Sage Business Cloud Compta & Facturation

Sage Business Cloud Compta & Facturation : comptabilité et facturation en ligne pour TPE, connexion bancaire automatique, conformité française (TVA, FEC) et application mobile.

Prix:

9.00€ - 25.00€/mois HT

100% cloud, accessible partout

Synchronisation bancaire et rapprochement automatisés

Alternative
Ciel

Ciel

Ciel (Sage) simplifie la comptabilité, la facturation et la gestion commerciale des TPE-PME en France, avec support local et conformité aux normes légales françaises.

Prix:

À partir de 10,50€/mois

Marque Sage (Ciel) établie en France depuis 1986

Comptabilité et facturation complètes pour TPE-PME

Alternative
Kolirys

Kolirys

Kolirys est un outil de facturation et gestion d'entreprise 100% français et gratuit, certifié conforme loi anti-fraude TVA, pensé pour simplifier la comptabilité des auto-entrepreneurs et PME.

Prix:

Gratuit (dès 9.90€ HT/mois)

Formule gratuite réellement complète : accès illimité aux devis, factures et clients pour auto-entrepreneurs et entreprises individuelles, sans frais

Conforme à la réglementation française : certifié loi anti-fraude TVA et en cours d'agrément pour la facturation électronique 2026

Alternative
Cegid

Cegid

Cegid regroupe plusieurs gammes distinctes sous une même marque. Cegid Business cible les TPE, Cegid Quadra les cabinets comptables. Cegid PME et Cegid ETI couvrent les structures de 2 000 à 5 000 salariés. Cette page vous aide à identifier la ligne adaptée à votre taille d'entreprise. Le tableau ci-dessous récapitule le périmètre, le mode de déploiement et le tarif relevé pour chaque gamme.

Prix:

À partir de 16.95€ HT/mois

Suite cloud ERP, comptabilité et RH modulaire et évolutive

Expertise par métier et par secteur (comptabilité, paie, retail)

Comparaison détaillée

LogicielPrixUsersFactu.FRMobileAPI
Pennylane
Pennylane
4.6
14€ - 79€/mois HTPar entreprise
Sellsy
Sellsy
3.8
De 35 à 79 € HT/utilisateur/mois, engagement 12 mois2 utilisateurs minimum
Axonaut
Axonaut
4.6
38 € HT/mois selon la durée1 inclus (+29,99 €/user)
JLogiciels
JLogiciels
5.0
Dès 29€/moisAbonnement SaaS (par utilisateur)
Facture.net
Facture.net
4.9
Hébergé: 0€/mois100% gratuit illimité
Qonto
Qonto
4.8
9€/mois (HT)600 000+ entreprises
MY.Facturation
MY.Facturation
4.8
Gratuit à 50.00€ HT/moisMulti-utilisateurs illimité
Indy
Indy
4.8
0 € ; Plus dès 9 € HT/mois en annuelMicro-entrepreneurs, entreprises individuelles, professions libérales, SCI, LMNP et sociétés à l'IS
Henrri
Henrri
4.7
0 € ; Expert dès 12 € HT/mois en annuelFreelances, auto-entrepreneurs, TPE de services et associations
Zervant
Zervant
4.5
0 € ; formules payantes selon l'offrePar compte (mensuel)
Evoliz
Evoliz
4.4
16€/mois HT (annuel)PME et TPE françaises
EBP Compta
EBP Compta
4.1
Dès 31,50 € HT/mois avec engagement1 utilisateur / 1 société sur l'offre Hubbix publique
Xero
Xero
4.0
De 29 à 75 $US/mois sur l'offre globaleUtilisateurs illimités
Sage Business Cloud Compta & Facturation
Sage Business Cloud Compta & Facturation
4.0
9.00€ - 25.00€/mois HTPar entreprise, multi-utilisateurs
Ciel
Ciel
3.9
10,50€/moisTPE et PME françaises
Kolirys
Kolirys
3.8
Gratuit (dès 9.90€ HT/mois)1-50+ utilisateurs
Cegid
Cegid
3.6
16.95€ HT/moisSaaS ou licence par utilisateur

Questions
fréquentes

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