Meilleur logiciel Facturation Agréé pour Experts-comptables
Découvrez notre classement des meilleurs logiciels de facturation électronique pour cabinets d'experts-comptables. Gestion multi-clients et intégration comptable native.
Vous êtes expert-comptable et cherchez le meilleur logiciel de facturation électronique pour votre cabinet et vos clients ? On a testé et comparé 10 solutions agréées PA/PDP avec gestion multi-clients intégrée.
Pourquoi ce comparatif pour les experts-comptables ?
La réforme de la facturation électronique 2026 transforme profondément le métier d'expert-comptable. Les cabinets doivent non seulement être conformes pour eux-mêmes, mais aussi accompagner leurs clients dans cette transition majeure.
Dès septembre 2026, tous les cabinets devront être capables de recevoir des factures électroniques. Et à partir de septembre 2027, ils devront également les émettre. Une amende de 15€ par facture (plafonnée à 15 000€/an) est prévue en cas de non-conformité.
Le choix du bon logiciel est donc stratégique : il doit permettre la gestion multi-clients, s'intégrer nativement à votre production comptable, et offrir un portail client efficace. Nous avons testé 10 solutions pour vous aider à faire le bon choix.
Notre méthodologie
Test de chaque solution avec un compte cabinet multi-clients
Évaluation de l'intégration avec les logiciels de production comptable (Sage, Cegid, ACD)
Analyse du portail client et des fonctionnalités de collaboration
Vérification du statut PA/PDP sur le registre officiel de la DGFIP
Test de l'import/export des écritures comptables et rapprochements
Évaluation du support dédié cabinets et formation disponible
Ce classement est établi en toute indépendance. Nous ne percevons aucune commission sur les ventes. Les éditeurs ne peuvent pas payer pour améliorer leur position.
Notre classement
iPaidThat automatise la précomptabilité des TPE et PME grâce à l'OCR des factures, la synchronisation bancaire et une facturation intégrée, pour réduire la saisie manuelle et limiter les erreurs.
Points forts
Collecte et traitement des factures largement automatisés pour réduire la charge administrative
OCR fiable et nombreux connecteurs bancaires disponibles
Rattaché au Groupe BPCE, ce qui apporte une certaine visibilité sur la pérennité de l'éditeur
Inconvénients
Positionnement tarifaire qui peut décourager les très petites structures
Interface qui peut dérouter lors des premières semaines d'utilisation
Dépendance forte aux automatisations : en cas de dysfonctionnement, l'impact est significatif
Prix
Dès 59€/mois
Utilisateurs
Par entreprise (utilisateurs inclus)
Essai gratuit
14 jours
Support
Chat & Email
Points forts
Pilotage de trésorerie en temps réel
Synchronisations bancaires et paiements intégrés
Compte pro et cartes inclus pour centraliser les dépenses
Inconvénients
Automatisations avancées limitées sur le plan Basique
Tarifs qui montent avec la taille de l'entreprise et le nombre de salariés
Prix
14€ - 79€/mois HT
Utilisateurs
Par entreprise
Essai gratuit
14 jours
Support
Chat & Email
Cegid est un éditeur français reconnu depuis 1983 : une suite cloud modulaire pour piloter ERP, comptabilité et RH, accélérer la conformité (DSN, fiscalité) et unifier vos processus de gestion.
Points forts
Suite cloud ERP, comptabilité et RH modulaire et évolutive
Expertise par métier et par secteur (comptabilité, paie, retail)
APIs et connecteurs pour relier l’ensemble de votre écosystème applicatif
Inconvénients
Tarification complexe et budgets élevés
Déploiement long et exigeant en ressources
Interface qui mériterait une modernisation
Prix
À partir de 14.90€ HT/mois
Utilisateurs
SaaS ou licence par utilisateur
Essai gratuit
14 jours
Support
Chat & Email
Autres alternatives à considérer
Sage 100
4.0
/5
Sage 100 : ERP modulaire pour PME alliant Comptabilité, Gestion commerciale, Facturation et Paie, conforme aux obligations françaises et pensé pour la croissance.
Prix:
À partir de 78€/mois HT (hébergé)
Suite modulaire PME éprouvée (Compta, Gestion co, Paie)
Conformité française (FEC, DSN) et support local
Dougs
4.1
/5
Prix:
Dès 29 € HT/mois
Accompagnement illimité et équipes réactives par chat, email ou visio
Interface accessible (web + mobile) avec synchronisation bancaire automatisée
Qonto
4.8
/5
Prix:
À partir de 9€/mois (HT)
Interface et support en français : Conçu pour le marché français, conformité locale
Facturation et comptabilité intégrées : Devis/factures, rapprochement automatique, export vers Sage, Cegid, Pennylane
Evoliz
4.4
/5
Prix:
À partir de 16€/mois HT (annuel)
Double certification NF 203 et NF 525 garantissant la conformité fiscale française
Facturation, synchronisation bancaire, stocks et CRM réunis dans un seul outil
Tiime
4.8
/5
Prix:
Gratuit (dès 17.99€ HT/mois)
Facturation gratuite illimitée
Compte pro bancaire intégré
Indy
4.8
/5
Indy est un outil français de comptabilité et de facturation destiné aux indépendants. Il propose un plan gratuit, une synchronisation bancaire automatique et un compte pro intégré pour simplifier la gestion du quotidien.
Prix:
Gratuit à 49.00€ HT/mois
Plan gratuit sans limite de durée pour démarrer sans engagement
Synchronisation bancaire automatique pour réduire la saisie manuelle
Axonaut
4.6
/5
Prix:
À partir de 34,99 € HT/mois
Plateforme 100% française tout-en-un : CRM, facturation, trésorerie, stock, comptabilité, compte pro et bien plus dans une interface claire et abordable
320 000 utilisateurs et adoption continue : déployée par plus de 12 000 structures françaises
Comparaison détaillée
| Logiciel | Prix | Users | Factu. | FR | Mobile | API |
|---|---|---|---|---|---|---|
 iPaidThat 4.0 | Dès 59€/mois | Par entreprise (utilisateurs inclus) | ||||
 Pennylane 4.6 | 14€ - 79€/mois HT | Par entreprise | ||||
 Cegid 3.6 | 14.90€ HT/mois | SaaS ou licence par utilisateur | ||||
Sage 100 4.0 | 78€/mois HT (hébergé) | Par module utilisateur | ||||
Dougs 4.1 | Dès 29 € HT/mois | 37000+ entreprises | ||||
Qonto 4.8 | 9€/mois (HT) | 600 000+ entreprises | ||||
Evoliz 4.4 | 16€/mois HT (annuel) | PME et TPE françaises | ||||
Tiime 4.8 | Gratuit (dès 17.99€ HT/mois) | Par entreprise mensuel | ||||
Indy 4.8 | Gratuit à 49.00€ HT/mois | Par entreprise, mensuel/annuel | ||||
Axonaut 4.6 | 34,99 € HT/mois | 1 inclus (+29,99 €/user) |
Notre conseil
En tant qu'expert-comptable, vous avez un double enjeu : équiper votre cabinet ET accompagner vos clients. Privilégiez les solutions qui proposent une offre cabinet avec portail client intégré. Testez avec 2-3 clients pilotes avant de déployer à l'ensemble de votre portefeuille.
Questions
fréquentes
Retrouvez ici les réponses aux questions les plus fréquentes.
Sources
Dernière vérification : 05/02/2026
- 1Facturation électronique - Ordre des Experts-Comptables
Ordre des Experts-Comptables
- 2Liste officielle des PA/PDP
DGFIP - Registre officiel
- 3Calendrier de la réforme
Ministère de l'Économie
Comment choisir ?
Votre choix doit prendre en compte à la fois les besoins de votre cabinet et ceux de vos clients. Voici les critères essentiels.
Critères essentiels pour un cabinet
Points d'attention